婴幼儿腹泻的治疗方法，需视病情而定。轻型腹泻可在家里治疗护理，重型腹泻应住院治疗。治疗由细菌引起的感染性腹泻，要根据病原体由医生选择适宜的抗生素，乱用抗生素会导致肠道正常菌群失调而造成迁延型腹泻；对病毒感染引起的腹泻，目前尚无特效药物；由饮食不当引起的腹泻应调整饮食；症状性腹泻应及时治疗原发疾病。无论是何因引起的腹泻，都要预防及纠正脱水。腹泻病儿即使无脱水症状，也应服用口服补液盐（ORS液）预防脱水；轻度脱水可继续服用口服补液盐纠正脱水，重度脱水则须到医院静脉补液。若孩子腹泻数小时，又有发热、呕吐或大便有黏液便、脓血便，或小孩已有口干、口渴、尿少的脱水表现都应及时就医。医院往往会采取以下措施：
(1)医生寻找腹泻原因，有无脱水、电解质紊乱等情况。检查身体、化验大便。
(2)对轻度的单纯性腹泻开一些帮助消化和止泻药。常常开口服补液盐”冲水喝，或饮水，吃稀饭等。
(3)对腹泻严重又有脱水表现的会收住院治疗。
(4)医生认为有细菌感染要给孩子用抗生素药物。